Dans un futur lointain, la mégalopole de Shiro City est ravagée par une guerre impitoyable entre les humains et les Neons, des créatures intelligentes possédant une immense force physique et des capacités destructrices. Le Tonium, une énergie mystérieuse, est l'un des moteurs de ce conflit. La frontière entre l'humain et la machine s'est estompée, et l'humanité lutte pour sa survie.

Ren Takeda, un orphelin de 21 ans, porte en lui un secret qui aurait pu le détruire. Il est l'un des "Neomains", des êtres humains génétiquement modifiés pour devenir des armes vivantes. Transfiguré par des pouvoirs néon, Ren est plus fort et plus rapide qu'un être humain ordinaire, mais sa conscience reste intacte. Les horreurs de son passé, marquées par sa transformation forcée, le hantent sans cesse.

Ren parvient à s’échapper du contrôle des Neons et découvre la terrible vérité : il n’est qu’un pion dans un conflit bien plus vaste. Les Neons ne cherchent pas seulement à éradiquer les humains, mais également à prendre le contrôle du Tonium, une énergie aux pouvoirs démesurés. Sa nature même, modifiée par cette source d’énergie mystérieuse, pourrait bouleverser l'équilibre du monde.

Dans un monde contrôlé par des mégacorporations, Ren rencontre une organisation secrète, les Néon-Errants. Ces guerriers survivent dans un monde hostile et luttent pour l'élimination des Neons, convaincus que seule la destruction de ces créatures peut sauver l’humanité. Cependant, cette quête les rend aussi impitoyables que ceux qu’ils combattent, et Ren doit jongler avec ses alliances, ses doutes et sa propre quête de sens.

Pris dans un tourbillon de trahisons, de manipulations et de révélations, Ren devra faire face à un choix déchirant : se battre pour l'humanité ou embrasser sa nouvelle identité néon pour comprendre la vérité derrière le Tonium.